Una investigadora del Centro de Regulación Genómica (CRG) de Barcelona ha contribuido a la creación de nuevas directrices para mejorar la claridad, interpretabilidad y reproducibilidad de las imágenes microscópicas y el análisis de datos asociados en las publicaciones científicas.
Un grupo formado por 58 científicos de 48 institutos aborda la necesidad urgente de estándares unificados para mejorar la reproducibilidad de las imágenes. Nadia Halidi, miembro del grupo de trabajo responsable y jefa de la Unidad de Microscopía Óptica Avanzada del Centro de Regulación Genómica, dice: "Estamos abordando un problema antiguo. Incluso los primeros usuarios del microscopio, Robert Hooke y Antoni van Leeuwenhoek, no desglosaron los detalles metodológicos completos. A medida que las mejoras tecnológicas en el campo ganan ritmo, es más importante que nunca crear pautas estandarizadas y evitar la introducción de errores involuntarios y retrasos en las publicaciones científicas".
Para abordar este reto, la comunidad internacional de microscopía ha trabajado durante los últimos dos años y han creado las primeras directrices unificadas de este tipo. Presentan sus resultados en un artículo publicado en la revista Nature Methods en forma de lista de verificación, o checklist, que ha sido diseñada para ayudar a cualquier investigador o investigadora a preparar y analizar datos de microscopía óptica para publicaciones.
Las listas abordan recomendaciones clave para el formato de imagen, la anotación, la selección de color, la disponibilidad de datos y los flujos de trabajo de análisis de imágenes de informes. Si se adopta su uso, los autores creen que la ciencia se beneficiará de unos datos de microscopía más claros, estandarizados y reproducibles.
Halidi recuerda haber pensado por primera vez en la importancia de las nuevas directrices durante una experiencia personal durante sus estudios de doctorado: "Tenía muchísimos obstáculos intentando replicar el trabajo de un exalumno debido a la falta de documentación adecuada y la falta de claridad en la adquisición de imágenes y el análisis de datos", comenta.
“La ausencia de documentación exhaustiva a menudo nos obliga a empezar de cero, desperdiciando tiempo y recursos preciosos, y también compromete la reproducibilidad de los datos obtenidos. Estas listas son una respuesta importante a esta problemática y beneficiarán a la ciencia en todo el mundo,” añade Dra. Halidi.
La Dra. Halidi también confía en que las directrices serán adoptadas y servirán a la comunidad científica: "El cambio comienza con concienciar a las personas. Necesitamos difundir esta información no solo entre los estudiantes de doctorado, sino en todos los niveles de la investigación". En cuanto al objetivo de llegar a la investigación con reproducibilidad universal la doctora agrega: "Esperemos que lleguemos allí. Es un esfuerzo de colaboración que involucra revistas, instituciones, unidades de servicios científicosy científicos y científicas individuales".
Los autores del estudio reconocen que, a medida que avanzan la tecnología y la investigación, las listas propuestas requerirán actualizaciones periódicas. El objetivo es que las directrices sean continuamente refinadas por la comunidad de microscopía y que sean adaptables para futuros desafíos que estén en línea con la innovación tecnológica.
Las directrices fueron desarrolladas por el grupo de trabajo de visualización y análisis de imágenes de QUAREP-LiMi, un grupo de trabajo internacional de expertos en imágenes de microscopía óptica de la academia y la industria. Fueron redactadas por expertos de cuarenta y ocho organizaciones, dirigidas por Helena Jambor en TU Dresden y Christopher Schmeid en Human Technopole. El grupo de trabajo incluye miembros de instituciones de investigación académica como el Centro de Investigación Ames de la NASA o el Instituto Karolinska, así como líderes de la industria como Nikon Instruments y Carl Zeiss y más. La Dra. Halidi fue la principal contribuyente a este trabajo en España.
Imagen: Un grano de polen capturado con 3 modalidades de imagen diferentes. De arriba a abajo, de izquierda a derecha: técnicas de microscopía de campo amplio, confocal y airyscan (barra de escala: 10 µm). Crédito: Nadia Halidi/Centro de Regulación Genómica
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