CIC bioGUNE forma parte del TOP 100 mundial de centros de investigación sin ánimo de lucro en el ámbito de la biomedicina según el ranking elaborado por la prestigiosa revista científica Nature para el año 2019. El centro se sitúa en el puesto 82 y comparte el TOP 100 con instituciones punteras de todo el mundocomo el Max Planck (Alemania), Scripps Research (Estados Unidos), HelmholtzAssociation of German Research Centres (Alemania), Francisc Crick Institute(Reino Unido), Leibniz Association (Alemania), Salk Institute for Biological Studies (Estados Unidos), HHMI Janelia Farm Research Campus (Estados Unidos), Fred Hutchinson Cancer Research Center (Estados Unidos), Wellcome Trust Sanger Institute (Reino Unido) o Barcelona Institute of Science and Technology (España), que ocupan los 10 primeros puestos de la clasificación. El ranking 2019 se establece en función de una serie de parámetros que miden la cantidad y la calidad de las publicaciones de los centros, así como el prestigio y la influencia de los autores de cada centro en el periodo 2015-2018. Desde su inauguración en 2005, los investigadores de CIC bioGUNE han publicado más de 1.000 artículos en revistas científicas que han sido citados más de 20.000 veces.
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