El equipo de Genómica Comparada y Metagenómicadel CBGP (UPM-INIA), dirigido por el Dr. Jaime Huerta Cepas, ha sido seleccionado para ser financiado con un proyecto de la Iniciativa Chan Zuckerberg (CZI) para el desarrollo de software bioinformático orientado al análisis filogenómico.

El premio se enmarca dentro de la convocatoria internacional Essential Open Source Software for Science de la CZI, dirigida a apoyar el software científico de código abierto más crítico para la investigación en biología y medicina.

El grupo de investigación liderado por el Dr. Huerta Cepas trabaja principalmente en el desarrollo de métodos computacionales destinados al estudio de la evolución, ecología y función de genes microbianos. Esta ayuda, de un año de duración, proporcionará fondos para impulsar el lanzamiento de una nueva versión del software ETE Toolkit, una herramienta orientada a la reconstrucción, análisis y visualización de datos filogenómicos. Los principales objetivos del proyecto se centran en la mejora de los métodos de comparación de los árboles filogenéticos y la visualización de grandes filogenias.

Para el investigador Jaime Huerta“Contar con financiación expresamente dedicada al mantenimiento de software bioinformático representa una ayuda muy importante a la investigación. ETE lleva en desarrollo más de 10 años, cuenta con decenas de miles de descargas y atendemos peticiones de soporte diariamente. Sin embargo, este y otros proyectos similares carecen de financiación estructural.“

El software de código abierto es crucial para la investigación científica moderna, el avance de la biología y la medicina, además de aportar reproducibilidad y transparencia. Sin embargo, incluso el software más utilizado en el ámbito científico a menudo carece de fondos para su mantenimiento o mejora. Con estas ayudas de la CZI, los 23 proyectos galardonados podrán contratar desarrolladores de software adicionales, mejorar la documentación, abordar la usabilidad, mejorar la compatibilidad e implementar nuevas funcionalidades.

Según Cori Bargmann, Jefe del programa de Ciencia de la CZI, "Cientos de miles de científicos utilizan cada día software de código abierto para llevar a cabo sus investigaciones. Los científicos merecen mejores herramientas, y estamos ayudando a satisfacer esa necesidad apoyando proyectos de código abierto que harán avanzar la ciencia biomédica y fomentarán un mejor acceso al software crítico".

Acerca de la Iniciativa Chan Zuckerberg

Fundada por la Dra. Priscilla Chan y Mark Zuckerberg en 2015, la Iniciativa Chan Zuckerberg (CZI) es un nuevo tipo de filantropía que está aprovechando la tecnología para ayudar a resolver algunas de las desafíos más difíciles - desde la erradicación de las enfermedades, a la mejora de la educación, o la reforma de la sistema de justicia penal. En las tres esferas principales de la Iniciativa, a saber, la ciencia, la educación y la justicia y Oportunidad, estamos uniendo la ingeniería con la concesión de subvenciones, la inversión de impacto, y la política y trabajo de defensa para ayudar a construir un futuro inclusivo, justo y saludable para todos. Más Información en www.chanzuckerberg.com.

Acerca del CBGP (UPM-INIA)

El Centro de Biotecnología y Genómica de Plantas (CBGP) es un centro mixto UPM / INIA cuya misión es llevar a cabo investigaciones fundamentales y estratégicas sobre la biología de plantas y microorganismos asociados. En particular se aborda el estudio del desarrollo de las plantas, sus mecanismos de nutrición, y la interacción de éstas con el medio ambiente. Los conocimientos adquiridos se utilizan para abordar los principales problemas de la agricultura y la silvicultura hoy en día, así como para desarrollar nuevas soluciones tecnológicas. Para ello, el CBGP cuenta con un Programa de Biología de Sistemas y Genómica Computacional en el que se realizan análisis, predicciones y modelos a escala genómica. La misión de este programa es revolucionar la investigación vegetal y agrícola mediante la aplicación de enfoques globales que permitan mejorar el crecimiento de las plantas, aumentar la productividad y prevenir enfermedades.

El CBGP (UPM-INIA) ha sido reconocido por la Agencia Española de Investigación como Centro de Excelencia Severo Ochoa, el más alto reconocimiento institucional de la excelencia de la investigación científica en España.

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