El equipo multidisciplinar que conforma el Programa Conjunto de Cáncer Hereditario del Instituto Catalán de Oncología-Instituto de investigación biomédica de Bellvitge y el Instituto Germans Trias i Pujol ha dado un paso adelante en el diagnóstico de personas con una alta predisposición genética a desarrollar cáncer mediante el desarrollo y la implementación de una nueva estrategia diagnóstica. Basada en herramientas genómicas y en la utilización de análisis bioinformáticas propias, esta estrategia mejora la eficiencia diagnóstica gracias a que permite secuenciar todos los genes de cáncer hereditario a la vez y analizarlos por paquetes según la presentación o sospecha clínica del paciente.

En los seis meses desde su implementación ya se han podido beneficiar más de 700 personas. El desarrollo y la implementación de este nuevo sistema de diagnóstico genético se acaba de publicar en dos artículos en la revista Scientific Reports.

Reducir el impacto del cáncer a partir del diagnóstico genético: nuevos retos tecnológicos

El Programa Conjunto de Cáncer Hereditario ICO-IDIBELL-IGTP trabaja intensamente para reducir el impacto del cáncer en Cataluña mediante la identificación de alteraciones en genes que, cuando están mutados en individuos y familias, elevan el riesgo de desarrollar cáncer. Actualmente, el campo del diagnóstico genético está viviendo una revolución con la aplicación de las nuevas metodologías de secuenciación masiva o de nueva generación (Next Generation Sequencing, NGS, en inglés).

Estos avances están cambiando el paradigma del diagnóstico genético, ya que se ha pasado de analizar uno o pocos genes, a analizar decenas o cientos a la vez (lo que se denomina paneles de genes) o incluso, todos los genes del genoma humano (exoma). Estas nuevas posibilidades de análisis permiten identificar la alteración genética causante de la alta predisposición al cáncer de manera mucho más eficiente, especialmente en individuos y familias donde el diagnóstico clínico de esta predisposición es complejo.

Es en este contexto donde el Programa Conjunto ICO-IDIBELL-IGTP ha desarrollado una nueva estrategia diagnóstica, llamada I2HCP, que permite secuenciar todos los genes de cáncer hereditario a la vez y analizarlos posteriormente por paquetes de manera personalizada según la sospecha clínica del paciente. La nueva estrategia ha permitido mejorar la eficiencia del diagnóstico y dar respuesta a más de 700 pacientes desde que el I2HCP se implementó el sistema catalán de salud hace seis meses.

Nueva estrategia diagnóstica publicada en dos trabajos en Scientific Reports

La prestigiosa revista científica Scientific Reports acaba de publicar dos artículos liderados por el Programa Conjunto de Cáncer Hereditario ICO-IDIBELL-IGTP donde se presenta la nueva estrategia de diagnóstico I2HCP y se compara con otras estrategias existentes.

En el primer artículo se describe el desarrollo, validación e implementación de la nueva estrategia diagnóstica, un proceso de innovación y traslacional que ha requerido un esfuerzo continuo durante los últimos años. Al tratarse de un sistema propio, permite retener todo el conocimiento y el control sobre todo el proceso de diagnóstico, proporciona una alta flexibilidad en el análisis y acelera la incorporación de nuevos genes con utilidad clínica. El artículo identifica estos factores como claves para entender la mejora del diagnóstico genético.

La implementación de este sistema ha requerido un cambio en la manera de trabajar en los grupos de diagnóstico genético, que ha pasado a ser totalmente multidisciplinar debido al alto número de habilidades que se requieren: diagnóstico genético molecular, tecnologías genómicas, diagnosis clínica y de oncogenètica, consejo genético, bioinformática, etc. El trabajo también pone en valor la posibilidad de utilizar esta tecnología para cuantificar de forma más personalizada el riesgo genético a desarrollar cáncer.

El segundo trabajo publicado ha contado con la colaboración del equipo del Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG) - CRG. En este trabajo se compara el rendimiento en el diagnóstico genético del nuevo panel en relación a un panel de genes comercial y al estudio de todos los genes del genoma. El estudio compara las diferentes estrategias en un serie de 24 pacientes, 10 portadores de una mutación conocida (serie control) y 14 con sospecha de cáncer hereditario pero con mutación previamente no identificada (serie descubrimiento) y resalta la idoneidad de la estrategia desarrollada por el Programa Conjunto ICO-IDIBELL-IGTP en Cáncer Hereditario.

Más información:

Benchmarking of Whole Exome Sequencing and Ad Hoc Designed Panels for Genetic Testing of Hereditary Cancer.

A comprehensive custom panel design for routine hereditary cancer testing: preserving control, improving diagnostics and revealing a complex variation landscape.

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